NPM1 djupsekvens
18127
NPM1 mutationsanalys
Synonymer
NPM1 djupsekvens \ MRD, measurable residual disease
Provtagningsanvisning
Provmaterial
Leukocyter
Rör el. motsv
Vakuumrör K2-EDTA K3-EDTA
Provtagning
10 mL venblod eller 0,5-1 mL benmärgsaspirat blandas väl
Undvik provtagning före helg. Vid frågor kontakta Genetiklaboratorier pav 8 031-3427891
Undvik provtagning före helg. Vid frågor kontakta Genetiklaboratorier pav 8 031-3427891
Hantering
Provröret vänds minst 5 ggr (fram och åter) efter provtagning. Förvaras kylt. Provet sänds ocentrifugerat till laboratoriet. I rumstemperatur
Transport
Ocentrifugerat prov lämnas till laboratoriet inom 24 h
Remiss
Remissord
NPM1 djupsekvens
Metod
Metodtyp
NPM1 djupsekvensering (NGS)
Enhet
%
Ackrediterad
Nej
Bakgrund
Förvärvade mutationer i genen nukleophosmin (NPM1) påträffas i leukemiceller hos 30% av vuxna med akut myeloisk leukemi (AML) och 7% av barn med sjukdomen. För analys av measurable residual disease (MRD) rekommenderas vid NPM1-mutaton molekylär analys. Vid den vanligaste mutationstypen, typ A (NPM1 c.860_863dupTCTG, p.(Trp288CysfsTer12)), används vid vårt laboratorium för detta ändamål kvantitativ PCR (NPM1/ABL1). För patienter med annan NPM1-mutation än typ A används istället djupsekvensering för MRD-analys. Analysen utförs på DNA och besvaras som variantallelfrekvens (VAF) av mutationen. Analysen är kvantitativ ner till VAF 0,01% och har en teoretisk känslighet på VAF 0,0015%. Vid MRD-analys med djupsekvensering behöver remissen innehålla information om vilken specifik NPM1-mutation som påvisats vid diagnos, däremot behövs inget diagnosprov för utgångsvärde.
Indikation för analysen är uppföljning av AML med mutation i NPM1 av annan typ än typ A.
Indikation för analysen är uppföljning av AML med mutation i NPM1 av annan typ än typ A.
Klinisk kemi
Postadress:
Klinisk kemi
Sahlgrenska Universitetssjukhuset
413 45 Göteborg
För frågor kring analyser eller provsvar, kontakta vår helpdesk, tel 031 – 342 13 25.
Fler olika kontaktuppgifter/leveransadresser finns, se respektive remiss.
Postadress:
Klinisk kemi
Sahlgrenska Universitetssjukhuset
413 45 Göteborg
För frågor kring analyser eller provsvar, kontakta vår helpdesk, tel 031 – 342 13 25.
Fler olika kontaktuppgifter/leveransadresser finns, se respektive remiss.